Андрей Погорелый пишет: Бороться нужно с теми, кто использует CSS фреймворки.
В вашем же случае можно попробовать проследить через Firebug, какие именно правила ломают эти окна, и попробовать исправить ситуацию.
скриншот сделан с отрубленым css файлом ... подключен тока lesscss.js короче говоря не подключены правила, которые бы ломали окно... его ломает сам lesscss.js