Вам нужны 2 файла из стандартных в /bitrix/modules/catalog/load (yandex_run.php - экспорт, yandex_setup.php - настройки). Скопируйте и переименуйте эти файлы до символа _ (например myexport_run.php и myexport_setup.php), в первой строке поменяйте название в теге <title>. Разместите эти файлы в /bitrix/php_interface/include/catalog_export/. При этом гарантировано ничего не затрется, а ваш импорт появится в общем списке в админке.