conponent_epilog вызывается в рамках подключения шаблона. Работа с мета-тегами в компонентах ведется после. С выходом iblock 14.5.6 можно будет отключать установку любых мета-тегов в компонентах news.list, news.detail, catalog.element, catalog.section. Кроме того, я решал бы проблему путем модификации $arResult в result_modifier.php с последующим кешированием результатов.