Файлы архива лежат в /upload/1c_catalog. Они пришли?
Если пришли, советую модуль [url=http://marketplace.1c-bitrix.ru/solutions/askaron.pro1c/]Продвинутый обмен с 1С[/url]. Там можно включить лог-файл и Живой лог, чтобы посмотреть, что у вас. Может обмен идет, но только очень медленно. А может и дошел до конца.
------
Если файлы выгрузки так и не пришли в /upload/1c_catalog, тогда ошибка точно в 1С. Надо разбираться с 1С. Писать в техподдержку Битриксу
-------
На одном из проектов у нас была проблема с открытием отчетов в 1С. Мы не видели, как прошел обмен, потому что была какая-то ошибка XML с кракозяброй.
Но сейчас у нас стоит новое дополнение для 11.1.2.22 и ошибка XML не возникает.
Можете, как вариант, создать новую настройку обмена. Но нет гарантии, что ошибка XML не повторится.