Александр, а если после изменений вручную запросить файл стилей в браузере - site.ru/bitrix/templates/имяшаблона/template_style.css, в нем внесенные изменения будут видны? Если нет - ctrl+f5, видны? Если видны - теперь смотрите на сайт, есть изменения?