В версии модуля магазина 8.5.0 этот функционал реализован. В настройках компонента bitrix.sale.order.ajax поставить галочку "разрешать оформление заказа без регистрации" (пользователь генерируется автоматически и незаметно для клиента при условии, что в ядре включена самостоятельная регистрация и отключено подтверждение регистарции по E-mail)