Дополнительные пользовательские поля

Особо нет, только кастомные (чьи то, на сторонних ресурсах).


В коде и других статьях


При обновлении битрикса, если нет конфликта - нет.
То есть можно создавать сколько угодно полей, они не удаляться, но если тип используемых кастомных полей будет использован битриксом в дальнейшем, то естественно могут быть проблемы. Но сами поля и значения исчезнуть не должны


Да. Если пользователь может редактировать задачу, то и пользовательское поле он сможет редактировать

Нет, не сможете.
API на получение дел не будет работать с Вашими полями, т.к. оно и знать не знает про какой-то там CRM_ACTIVITY.
Т.е. после добавления Вам нужно будет внести изменения в соответствующие компоненты и модели, чтобы их увидели и отчеты и формы добавления/редактирования и карточки. Соответственно проделать это нужно будет не только с модулем CRM но и раскопать как работает конструктор отчетов.

Самый простой способ - хранить данные в своей таблице и написать кастомный отчет.

Нужно разбираться подробнее. Чего именно нехватает? Где? Как достаете?


Вытаскивать данные через SQL не зная структуры дело бессмысленное, так что нужно понять что вы хотите и уже исходя из этого думать как это сделать. Сейчас, не зная цели, это похоже на гадание на кофейной гуще.

Модифицировать данный конструктор очень неблагодарное дело, поэтому обычно мы пишем собственный компонент который делает строго заданный отчет по определенным параметрам.

Если модиифицировать в папке /bitrix/components/bitrix (чего делать нельзя), то да.
Если выносить их в /local/components/bitrix/ то не будут стерты, но при обновлении нужно всегда сравнивать чтобы старый код не отличался от нового (компоненты бывают обновляются и если вы не обновите свой, то он перестанет работать вообще)