Естественно. Вы можете переносить в свое пространство имен.
Тут только стоит уточнить (судя по поставленному вопросу документацию вы не читали
. Вы изменяете сами компоненты или шаблоны компонентов?
1. Если компоненты: переносите примерно так (предположим news.list):
/bitrix/components/bitrix/news.list копируете в /bitrix/components/karina/news.list где "karina" это каталог исключительно ваш (можете сами придумать название, но так чтобы не пересекалось с другими разработчиками, чьи модули используете)
После этого подключать надо иначе. Не bitrix:news.list, а karina:news.list
2. если шаблон компонента. ТО в режиме правки копировать нужный шаблон в шаблон сайта (это есть в меню)