"Виртуальная машина с «1С-Битрикс24» - CRM" как создать дополнительный сайт

Bitrix24 + CRM предназначена для разворачивания портала внутри офиса с помощью 1 кнопки. Там автоматически скачивается дистр Битрикс24 и после его установки  все готово для работы продажников в CRM. Эта машина не предназначен для мультисайтовости.

в BitrixVM функционал шире, на ней можно запускать неск сайтов и порталов одновременно.

Фактически, дистр Bitrix24+CRM основан на той же BitrixVM, только урезан по функционалу, который не нужен при разворачивании CRM в офисе.

Добавить руками сайты вы можете, но при следующем обновлении машины ваши правки в системных конфигах апача, nginx и т.п могут быть затерты обновлением.

Решать вам.
Я бы все-таки ставил BitrixVM, если вам нужно несколько сайтов