Видимо CDN закэшировал у вас некорректно данные, и подсовывал их потом.
С объединением скриптов и css тоже нужно быть аккуратнее. Сайт для этого нужно подготовить.
Например, данные у скрипта инициализируются в хеадере, а сам скрипт подгружается из файла.
После объединения js инициализация может оказаться после подключения скрипта и скрипт просто не сможет корректно работать. Бывают ситуации наоборот.
А ещё эта штука (объединение) тоже кэширует все после объединения. И может выплевывать вам данные, которые вроде бы уже изменены...
В общем в каждой профессии свои пинцеты требуются
