Количество на складе ?????

Это значит, что у Вас включен складской учет. В этом случае работа с количеством товара ведется через документы складского учета.

Админка - Магазин - Складской учет - Документы. Документ называется "Приход товара на склад". Интеграция с 1С тут абсолютно не при чем.

Складской учет внутри Битрикса - это как раз тот случай когда у вас нет 1С, и вы пытаетесь простенький учет вести с помощью Битрикса, если у вас есть 1С и вы планируете ее интегрировать с Битрикс, эту галочку нужно обязательно отключить.

Что за файл? Документация по какой версии?

Кроме документации, почитайте вот этот пост:

http://dev.1c-bitrix.ru/community/blogs/product_features/new-update-catalog-1255-and-sale-1256.php - здесь только кусочек относится к учету, и как раз рассказывается как сделать и что выбрать когда 1С делает все, а сайт только набирает заказы + описывается очистка, что бы начать учет.

Евгений Жуков,Спаси, дружищще. А как мне теперь вернуть все обратно. Какую галочку нужно снять, чтобы можно было учет на складе вести вручную (править доступное количество)???