Для начала вам надо посмотреть, что за ошибку выдает система. Для этого в файле /bitrix/php_interface/dbconn.php поставьте строчку внизу
$DBDebug = true;
После этого попробуйте еще раз повторить шаг, приводящий к ошибке БД.
Я догадываюсь, что за ошибка - вы добавляете в таблицу очень большое количество данных. И настройки MySQL не принимают их. Хоть убейте, я не помню, что за параметр отвечает за величину INSERT'а в MySQL. Может другие участники подскажут.
Сразу скажу, что виртуальные хостинги не позволят его изменить.