Проверьте права на просмотр и покупку для того типа цен, который сейчас для товаров, которые выводятся как отсутствующие. Если все нормально (у группы Все пользователи есть права на просмотр и покупку), проверьте настройки компонента - выбраны ли для показа нужные типы. цен. Если нигде не обнаружите проблем, создайте обращение в техподдержку, пожалуйста.