Можно использовать расширенные настройки веб-форм.
1. Создать вопрос "Подразделение" в виде выпадающего списка, где текст (ANSWER_TEXT) - название подразделения, а значение (ANSWER_VALUE) - e-mail.
2. Создать поле формы, например EMAIL_TO.
3. Добавить обработчик события, который после заполнения формы записывает в поле EMAIL_TO значение выбранного списка подразделений (т.е. e-mail).
4. В почтовом шаблоне формы в поле "кому" указать поле #EMAIL_TO#.