Всё, что находится между <?if($USER->IsAdmin()):?> и соответствующим <?endif?>, выводится только админу сайта. Предполагаю, что изначально <?endif?> был в шапке и включал скрипты, нужные только админу. При последующих редакторованиях <?endif?> был ошибочно перемещён в конец.