Добрый День. Это же зависит от настроек вашего хостинга. В настройках сайта, в битрикс, можно прописать конечно Server URL, но если переменная $_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] используется, то именно от ее значения зависит наличие "www" в url ваших ссылок. Возможно есть иной способ решить проблему кроме как использовать настройки хостинга.)