Ром, самое простое решение в лоб (без использования до настроек стороны 1С): делаешь отдельный классификатор - иблок и разделы, создаешь у разделов свойство "привязка к разделам" и привязываешь нужные тебе "человеческие" разделы к разделам иблока с классификатором который пришел из 1С. Можно множественную - будет проще свести в один раздел из кучи непонятных в 1С.
Как компоненты поправить сам можешь всем рассказать :)