Не совсем вас понял. Вы запустили BitrixVM, после чего зайдя через браузер восстановили старый сайт из архива или поставили демку. А сейчас хотите поставить еще один дополнительный сайт, так?
Если так то для этого в консольном меню есть пункт "Add aditional site" воспользуйтесь им для добавления нового сайта. для того чтобы потом через браузер на него попасть вам надо будет либо прописать в DNS запись для доменного имени сайта либо прописать его ip и имя в локальном файле hosts и в файле hosts на сервере.