Создается папка /bitrix/templates/шаблон
В этой папке пишется header.php, footer.php и служебные файлы
Тут же создается папка components, где создаются или копируются-модифицируются шаблоны для всех компонентов, которые будет модифицировать ваш шаблон (с учетом неймспейсовых папок, включая системные).
Вот потом эту папку в tar -czf, и если все правильно сделано, установить такой шаблон можно будет почти одним кликом.