В вашем случае у вас 10 процессов apache. На сообщения в логах не стоит обращать внимания, так как они не учитывают того, что на сервере используется 2-х уровневая конфигурация.
1. Ссылку исправили, спасибо что обратили внимание
2. [QUOTE]encyclopedia пишет: На первый взгляд, вроде бы ничему не мешает. [/QUOTE]В данном случае это не проблема и на работоспособности сервера никак не сказывается.
Возможно проблема в конвертере. Как вариант попробуйте сконвертировать машину BitrixVM4.2 или установить чистую CentOS6.3 и на нее установить BitrixEnv
1. rpm пакет не настраивает и не запускает iptables. Настройку файрволвера должен выполнить администратор. Для запуска попробуйте выполнить команду service iptables restart
2. пакет заменен, информацию скорректируем.
3. Не критичное уведомление от munin. В данном случае странность в поведение стандартного пакета.
Общение лучше продолжать в ветке про версию 4.2 а не 4.0
В большинстве случаев достаточно уже имеющегося ssh который позволяет подключаться к машине посредством sftp. В качестве клиентского ПО можно использовать WinSCP, подключение лучше выполнять от пользователя bitrix.
Если же вам все таки надо ftp то тогда можно установить proftpd, который имеется в стандартном репозитории и достаточно просто настраивается.