Для рабочего проекта лучше использовать не BitrixVM, а устанавливать чистый CentOS 6.x х64 и поверх него ставить BitrixEnv. Так как текущий образ BitrixVM собран на основе CentOS 6.x i386 у него есть ряд ограничений по ресурсам в среде Huper-V.
При развороте BitrixVM_Hyper-V на WinServer 2008 гостевая CentOSx86 6-6.2 поддерживает только 1 ядро, а на R2 уже от 1 до 4 ядер