Очень много информации на нашем сайте по настройке многосайтовости, но эта тема почему-то всегда вызывает много вопросов. Хотя на мой взгляд здесь всё довольно просто. Ну начнём с того, что на одной установке Битрикса можно сделать много сайтов (без покупки дополнительных лицензий можно сделать два сайта), а значит закроем первый вопрос: для настройки многосайтовости надо установить Битрикс только один раз. Есть довольно подробный учебный курс, где описывается два способа настройки многосайтовости.