Plohish, визуальный редактор работает нормально только когда на страничке каждый блок php кода заковычен своими <? ?>, а если, например, идет немного php кода, а потом подключение компонента, и все это в общем блоке <? ?>, то при редактировании через визуальный редактор все будет портиться, как вы пишите. Надо забить и редактировать в режиме кода.